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プライマー設計のためにcprimerを68k macにインストールする

プロトコル

テンプレートゲノムにアニールするヌクレオチド設計を感覚的にGUIで実行できるcprimerというソフトがあり、個人的に愛用している。

このソフトはGreg BristolとRobert Andersonの著作となっているが、Bob Andersonは1995年に故人となっており、Robert Andersonは行方が知れないという(下記メールアーカイブ参照)。
http://www.bio.net/hypermail/bio-software/1996-April/013943.html
よってバージョンアップや別環境への移植はなされていない。

そこで、以前設定したbasilliskIIの68k mac環境へcprimerを導入する方法を以下に記述する。 

 


1.cprimerのhqxファイルを以下からダウンロード。

 http://www.ibiblio.org/pub/academic/biology/molbio/mac/cprimer.hqx

 

2.HFVExplorerを起動、File→Openvolumeでkt753.dskを指定し、左側に現れたkt753.dskのアイコンの上に、右側に表示したCPrimer.hqxをドラッグ&ドロップする。コピーモードは「BinHex」を選択する。HFVEexplorerを終了する。

f:id:kiliwave:20141105125220p:plain

 

3.BasiliskIIを起動し、デスクトップ上のkt753ハードディスクにあるCPrimer.seaを、デスクトップにコピーします。 

f:id:kiliwave:20141105125723p:plain

 

4.CPrimer.seaをダブルクリックすると解凍場所を聞かれるので、画面のようにデスクトップを指定し「Extract」を選択します。

f:id:kiliwave:20141105130022p:plain

 

5.デスクトップに「CPrimer」ソフト本体と説明書「CPrimer notes - TEXT」が現れました。

f:id:kiliwave:20141105130418p:plain

 

6.起動画面は以下の通り。

f:id:kiliwave:20141105130700p:plain

 

7.リンゴマークから「About Cprimer」を選択しタイトル情報を確認することができます。

f:id:kiliwave:20141105130904p:plain

 

8.感覚的にprimerを設計することができます。

f:id:kiliwave:20141105131129p:plain

 

以上。